食品与健康学院（现代粮食产业学院）源于1958年的林产加工方向。2001年设立食品科学与工程学科，同年食品科学与工程专业开始招生。2003年，中药学学科创建，中药学专业招生。2011年食品质量与安全专业招生。2016年生物制药专业获批。2021年学校与浙江省粮食和物资储备局共建现代粮食产业学院。2021年，为适应新形势发展需要，食品科学与工程学科与中药学学科组建成立食品与健康学院（现代粮食产业学院），同年，浙江农林大学现代粮食产业学院入选省级重点支持现代产业学院建设点。目前开设食品科学与工程、食品科学与工程（粮油储检方向）、食品质量与安全、中药学、生物制药等本科专业，其中食品科学与工程专业为国家卓越农林人才教育培养计划专业、浙江省一流专业；中药学、生物制药专业为浙江省一流专业；食品质量与安全专业2012年起为浙江省定向培养基层农技人员（事业编制）；食品科学与工程（粮油储检）2015年起为浙江省粮食系统定向培养粮油储检人员。目前在校本科生1200余人。

学院建有野生动植物保护与利用二级博士点方向1个，食品科学与工程一级硕士学位授权点1个、中药学、食品加工与安全专业学位硕士学位授权点2个。目前在校研究生300余人。实现了本、硕、博贯通培养。

学院现有教职工96人，其中专任教师81人，博士生导师6人、硕士生导师48人，高级职称32人，具有博士学位71人。有国家“万人计划”领军人才、科技部中青年领军人才、农业农村部现代甘薯体系岗位科学家、浙江省151人才、浙江省高校高层次拔尖人才、浙江省师德楷模、浙江省突出贡献科技特派员等各类人才21人次。

学院设有食品科学与工程类本科生实践教学中心1个，包括啤酒生产、饮料生产、蒸煮和烘焙类食品生产等中试车间和实验教学中心；拥有国家级自然教育科普基地1个，省级大学生实践教育基地3个、校外实践教学基地36个。现有科技部-浙江省政府“省部共建亚热带森林培育国家重点实验室”、国家粮食与物资储备局“国家粮食产业（中温高湿区优质稻谷储藏）技术创新中心”、国家林业与草原局“森林健康食品产业国家创新联盟”“灵芝三叶青产业国家创新联盟”“国家林草三叶青西红花工程技术研究中心”、浙江省“浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室”等国家和省部级科研平台。为人才培养和科学研究提供了良好的硬件支撑。

学院高度重视并大力发展国内外学术交流合作，目前与美国、加拿大、意大利、德国、芬兰、丹麦、韩国、日本、塞尔维亚、波兰等多个国家的28所高校及科研院所建立了合作关系。

学院紧紧围绕食品、中药等大健康产业和行业发展的关键科学技术问题，与娃哈哈、五芳斋、绍兴黄酒、森宇集团、信达生物、寿仙谷医药、康恩贝、青春宝等知名企业开展战略合作。近5年来，学院承担各类科研课题200余项，其中国家级科研项目21项，省部级科研项目60余项，累计科研经费5000余万元，学院教师荣获国家科技进步二等奖、省部级科技成果一等奖、二等奖、三等奖10余项。